Konzept zur Kombination von Loose und Stringent Clustering Algorithmen zur cDNA Klon Selektion

  • Schreier, G. (Autor)
  • Martin Huber (Autor)
  • Silvia Fluch (Autor)

Aktivität: Vortrag ohne Tagungsband / VorlesungPräsentation auf einer wissenschaftlichen Konferenz / Workshop

Beschreibung

In der funktionalen Genomanalyse sind cDNA Microarrays nicht mehr wegzudenken. Ein Problem bei der Herstellung solcher EST-Microarrays ist die Redundanz, die diese Sequenzen aufweisen können. Die beschränkten Ressourcen des Microarrays in Bezug zur Anzahl der vorhandenen cDNA Klone, hier im speziellen die Populus sp. cDNA Klone der Platform for Integrated Clone Management, erfordern eine Reduktion der KLone mit redundanter genetischer Information auf ein Minimum. Das dazu entwickelte Konzept erlaubt es, verschiedene bereits etablierte Clusteringverfahren zu verwenden und diese unter Berücksichtigung der KOmpatibilität frei zu kombinieren.
Zeitraum10 Nov. 200512 Nov. 2005
EreignistitelÖGBMT Jahrestagung 2005
VeranstaltungstypKonferenz
BekanntheitsgradInternational

Research Field

  • Nicht definiert

Schlagwörter

  • Bioinformatik
  • gene clustering
  • expressed sequence tags - EST
  • Microarray