Friederike Trognitz

Suchergebnisse

• 2024

  BacFlux: A workflow for bacterial short reads assembly, QC, annotation, and more

  Antonielli, L. (Entwickler:in), Großkinsky, D. K. (Entwickler:in), Koch, H. (Entwickler:in), Trognitz, F. (Entwickler:in), Sanchez Mejia, A. (Entwickler:in) & Nagel, M. (Entwickler:in), 2024

  Publikation: Software › Open Source-Software

  Open Access

• BacFluxL: A workflow for genomic analysis of bacterial long reads

  Antonielli, L. (Entwickler:in), Koch, H. (Entwickler:in), Trognitz, F. (Entwickler:in), Nagel, M. (Entwickler:in), Sanchez Mejia, A. (Entwickler:in) & Großkinsky, D. K. (Entwickler:in), 2024

  Publikation: Software › Open Source-Software

  Open Access

• BacFluxL+: Bacterial genome analysis using short and long reads

  Antonielli, L. (Entwickler:in), Nagel, M. (Entwickler:in), Sanchez Mejia, A. (Entwickler:in), Koch, H. (Entwickler:in), Trognitz, F. (Entwickler:in) & Großkinsky, D. K. (Entwickler:in), 2024

  Publikation: Software › Open Source-Software

  Open Access

• Harnessing the plant microbiome for sustainable crop production

  Compant, S., Cassan, F., Kostić, T., Johnson, L., Brader, G., Trognitz, F. & Sessitsch, A., 15 Aug. 2024, in: Nature Reviews Microbiology. 15 S.

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• Reviewing the essential roles of remote phenotyping, GWAS and explainable AI in practical marker-assisted selection for drought-tolerant winter wheat breeding

  Chang-Brahim, I., Koppensteiner, L., Beltrame, L., Bodner, G., Saranti, A., Salzinger, J., Fanta-Jende, P., Sulzbachner, C., Bruckmüller, F., Trognitz, F., Samad-Zamini, M., Zechner, E., Holzinger, A. & Molin, E. M., 18 Apr. 2024, in: Frontiers in Plant Science. 15, 27 S., 1319938.

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  Open Access

  • Genome-Wide Association Study 100%
  • Drought Tolerance 50%
  • Unmanned Aerial Vehicle 16%
• 2023

  Correction to: Potato root-associated microbiomes adapt to combined water and nutrient limitation and have a plant genotype-specific role for plant stress mitigation

  Faist, H., Trognitz, F., Antonielli, L., Symanczik, S., White, P. J. & Sessitsch, A., 25 Apr. 2023, in: Environmental Microbiome. 18, 1, S. 37 5 S.

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• Ecology, functions and application of (soybean) seed endophytes.

  Trognitz, F., Escobar-Rodríguez, C., Mitter, B., Pfaffenbichler, N. & Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), Juni 2023, WSRC11 Book of abstracts.

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• Impact of conservation tillage on wheat performance and its microbiome

  Romano, I., Bodenhausen, N., Basch, G., Soares, M., Faist, H., Trognitz, F., Sessitsch, A., Doubell, M., Declerck, S. & Symanczik, S., 21 Aug. 2023, in: Frontiers in Plant Science. 14, 17 S.

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  • Microbial Activity 100%
  • Alkaline Phosphatase 50%

• Plant microbiota from rhizosphere to seeds

  Faist, H., Csorba, C., Escobar-Rodríguez, C., Trognitz, F., Brader, G., Antonielli, L., Kostic, T. & Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), 11 Juli 2023, FEMS 2023 abstract book.

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• Potato root-associated microbiomes adapt to combined water and nutrient limitation and have a plant genotype-specific role for plant stress mitigation

  Faist, H., Trognitz, F., Antonielli, L., Symanczik, S., White, P. J. & Sessitsch, A., 14 März 2023, in: Environmental Microbiome. 18, 5 S., 37.

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  • Cladistics 100%
• 2022

  ControlInRoad: Controlling invasive alien plant species along roads

  O´Brien, E., Trognitz, F. (Vortragende:r) & Hanslin, H. M., 2022, abstract book IENE 2022. S. 97 1 S.

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• Development of biocontrol applications against fungal and oomycete diseases

  Trognitz, F. (Vortragende:r, eingeladen), Antonielli, L. (Autor:in, eingeladen), Ringwald, T. (Autor:in, eingeladen), Ley, J. M. (Autor:in, eingeladen) & Sessitsch, A. (Autor:in, eingeladen), 2022, abstract book miCROPe 2022. 1 S.

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• From the ecology and functions of the plant microbiome to its importance in the food system

  Sessitsch, A. (Vortragende:r), Kostic, T., Faist, H., Trognitz, F., Buchholz, F., Maguin, E., D´Hondt, K., Sanz, Y., Berg, G., Schloter, M. & Schelkle, B., 2022, abstract book International Phytobiomes Conference 2022. 1 S.

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• From the idea to field application‐the development of biological solutions against weeds

  Trognitz, F. (Vortragende:r), 2022, abstract book OECD-CRP 2022. 1 S.

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• Microbial endophytes, molecular approach to explore them and endophyte-based applications

  Mitter, B. (Autor:in, eingeladen), Escobar-Rodríguez, C. (Autor:in, eingeladen), Pfaffenbichler, N. (Autor:in, eingeladen), Brader, G. (Autor:in, eingeladen), Kostic, T. (Autor:in, eingeladen), Compant, S. (Autor:in, eingeladen), Faist, H. (Autor:in, eingeladen), Csorba, C. (Autor:in, eingeladen), Trognitz, F. (Autor:in, eingeladen), Buchholz, F. (Autor:in, eingeladen), Zhao, Y. (Autor:in, eingeladen), Rodić, N. (Autor:in, eingeladen) & Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), 2022, abstract book Biocontrol & Biomes. 1 S.

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• Plant microbiome applications in the food chain and how to address application challenges

  Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), Faist, H. (Autor:in, eingeladen), Csorba, C. (Autor:in, eingeladen), Brader, G. (Autor:in, eingeladen), Trognitz, F. (Autor:in, eingeladen), Buchholz, F. (Autor:in, eingeladen), Zhao, Y. (Autor:in, eingeladen), Rodić, N. (Autor:in, eingeladen), Mitter, B. (Autor:in, eingeladen), Escobar Rodriguez, C. (Autor:in, eingeladen), Pfaffenbichler, N. (Autor:in, eingeladen) & Kostic, T. (Autor:in, eingeladen), 2022, abstract book Novo Nordisk Foundation conference. 1 S.

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• Potential and challenges of plant microbiome applications considering a food system approach

  Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), Mitter, B. (Autor:in, eingeladen), Escobar Rodriguez, C. (Autor:in, eingeladen), Pfaffenbichler, N. (Autor:in, eingeladen), Trognitz, F. (Autor:in, eingeladen), Faist, H. (Autor:in, eingeladen) & Kostic, T. (Autor:in, eingeladen), 2022, ISME18 program. 1 S.

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• 2021

  ControlInRoad: Controlling invasive alien plant species along roads

  Trognitz, F. (Vortragende:r), Follak, S., Alexander, F., Sedlacek, N., Herbert, S., Koch, M. & Sessitsch, A., 2021, abstract book of IENE 2021. S. 2 1 S.

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• Seed Endophytes Isolated From Soybean And Their Application For Biocontrol And Plant Growth Stimulation

  Trognitz, F. (Vortragende:r), Mayrhofer, H., Vanessa, W., González-López, O. & Sessitsch, A., 2021, EUCARPIA. S. 8-10 3 S.

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• The seed microbiome: diversity, functions and application potential

  Sessitsch, A. (Vortragende:r, Hauptvortrag), Trognitz, F. (Autor:in, Hauptvortrag), Escobar-Rodríguez, C. (Autor:in, Hauptvortrag), Pfaffenbichler, N. (Autor:in, Hauptvortrag) & Mitter, B. (Autor:in, Hauptvortrag), 2021, abstract book Biostimulants World Congress 2021. 1 S.

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• 2020

  A Compendium of genome-wide sequence reads from NBS (nucleotide binding site) domains of resistance genes in the common potato

  Prakash, C., Trognitz, F., Venhuizen, P., von Haeseler, A. & Trognitz, B., 2020, in: Scientific Reports. 10, 1 S.

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• Heritability and Functional Importance of the Setaria viridies Bacterial Seed Microbiome

  Escobar-Rodríguez, C., Antonielli, L., Mitter, B., Trognitz, F. & Sessitsch, A., 2020, in: Phytobiomes Journal. 4, S. 40-52 13 S.

  Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

• Microbiome innovations for sustainability

  Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), Faist, H., Trognitz, F., Mitter, B., Pfaffenbichler, N. & Brader, G., 2020, abstract book ASM Microbe 2024.

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• 2019

  Evaluating the diversity and functional potential of plant microbiota to improve the selection of potato genotypes able to cope with combined water and nutrient limitations

  Faist, H. (Vortragende:r), Trognitz, F., Symanczik, S., Antonielli, L., Mäder, P., White, P. & Sessitsch, A., 2019, Micrope Abstract Book 2019. S. 46 1 S.

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• Heritability and Functional Importance of the Setaria viridis Bacterial Seed Microbiome

  Escobar-Rodríguez, C., Antonielli, L., Mitter, B., Trognitz, F. & Sessitsch, A., 2019, in: Phytobiomes Journal. 1 S.

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• Plant associated bacteria for the control of Impatiens glandulifera

  Trognitz, F. (Vortragende:r), Lutz, L. & Sessitsch, A., 2019, MiCROPe 2019 abstract book. S. 57 1 S.

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• 2018

  Invasive alien plants along roadsides in Europe

  Follak, S., Eberius, M., Essl, F., Fürdös, A., Sedlacek, N. & Trognitz, F., 2018, in: EPPO Bulletin. 48, S. 256-265 10 S.

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  Open Access

• Management of invasive plants along roadsides

  Trognitz, F. (Vortragende:r), Fürdös, A., Eberius, M., Sedlacek, N. & Follak, S., 2018.

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• Roots and Panicles of the C4 Model Grasses Setaria viridis (L). and S. pumila Host Distinct Bacterial Assemblages With Core Taxa Conserved Across Host Genotypes and Sampling Sites

  Escobar-Rodríguez, C., Mitter, B., Antonielli, L., Trognitz, F., Compant, S. & Sessitsch, A., 2018, in: Frontiers in Microbiology. 9, 2708

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• Weed microbiome characteristics and the development of bio-herbicides

  Samad, A., Antonielli, L., Compant, S., Sessitsch, A. & Trognitz, F., 2018, in: IOBC-WPRS Bulletin Vol.135. 135, S. 48-50 3 S.

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• 2017

  Comparative genome analysis of a vineyard weed endophyte Pseudomonas viridiflava CDRTc14 with showing selective herbicidal activity

  Samad, A., Antonielli, L., Sessitsch, A., Compant, S. & Trognitz, F., 2017, in: Scientific Reports. 7, 17336, S. 1-33 33 S.

  Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

  Open Access

• Comparison of root and panicle microbiota of Setaria spp. suggest vertical transmission and the contribution of insects to endophytic assemblages

  Escobar-Rodríguez, C. (Vortragende:r), Mitter, B., Antonielli, L., Trognitz, F., Compant, S. & Sessitsch, A., 2017.

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• Ecology and Genomic Insights into Plant-Pathogenic and Plant-Nonpathogenic Endophytes

  Brader, G., Compant, S., Vescio, K., Mitter, B., Trognitz, F., Ma, L.-J. & Sessitsch, A., 2017, in: Annual Review of Phytopathology. 55, S. 61-83 23 S.

  Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

• Investigations of the structure, function and herbicidal potential of bacterial communities associated with grapevine and vineyard weeds

  Samad, A., Compant, S. (Vortragende:r), Trognitz, F., Antonielli, L. & Sessitsch, A., 2017, Plant BioProtech. S. 88 1 S.

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• Shared and host‐specific microbiome diversity and functioning of grapevine and accompanying weed plants

  Samad, A., Trognitz, F., Compant, S., Antonielli, L. & Sessitsch, A., 2017, in: Environmental Microbiology. 19, 4, S. 1407-1424 18 S.

  Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

• The Seed microbiota and plant growth and health

  Compant, S. (Vortragende:r), Mitter, B., Gonzalez-Lopez, O., Döring, M., Trognitz, F. & Sessitsch, A., 2017, Plant BioProtech. S. 39 1 S.

  Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband › Begutachtung

• Weed microbiome characteristics and the development of bioherbicides

  Samad, A., Antonielli, L., Compant, S., Sessitsch, A. & Trognitz, F. (Vortragende:r), 2017, Proceedings of the IPM 3.0. 1 S.

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• 2016

  Endophytic colonization from roots to seeds: ecology and how plants benefit

  Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), Mitter, B. (Autor:in, eingeladen), Escobar-Rodríguez, C. (Autor:in, eingeladen), Pfaffenbichler, N. (Autor:in, eingeladen), Compant, S. (Autor:in, eingeladen), Antonielli, L. (Autor:in, eingeladen) & Trognitz, F. (Autor:in, eingeladen), 2016, Abstract Book Keynote-Conference Phytobiomes.

  Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband › Begutachtung

• Genotype dependent microbiome of 60 different tomato cultivars Vortrag 67

  Hönigsberger, B., Antonielli, L., Samad, A., Horneburg, B. & Trognitz, F. (Vortragende:r), 2016, Tagungsband der 67. Jahrestagung. S. 57 1 S.

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• High-Quality Draft Genome Sequence of an Endophytic Pseudomonas viridiflava Strain with Herbicidal Properties against Its Host, the Weed Lepidium draba L.

  Samad, A., Trognitz, F., Antonielli, L., Compant, S. & Sessitsch, A., 2016, in: Genome Announcements. 0

  Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

• Microbial communities associated with grapevine and vineyard weeds Poster

  Samad, A. (Vortragende:r), Trognitz, F., Compant, S., Antonielli, L. & Sessitsch, A., 2016.

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• Seed-associated microbiota: composition, drivers and transmission routes employing the model plant Setaria viridis L.

  Escobar-Rodríguez, C. (Vortragende:r), Mitter, B., Antonielli, L., Trognitz, F., Compant, S. & Sessitsch, A., 2016, Abstrac Book Keynote-Conference Phytobiomes.

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• Soybean improvement through the application of endopyhtic bacteria

  González-López, O., Mayrhofer, H. & Trognitz, F. (Vortragende:r), 2016, Tagungsband der 67. Jahrestagung. S. 55 1 S.

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• The microbiome and its influence on plant growth and health

  Trognitz, F. (Vortragende:r, eingeladen), 2016, ABIM 2016.

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• The role of plant-microbiome interactions in weed establishment and control

  Trognitz, F., Widhalm, S., Hackl, E. & Sessitsch, A., 2016, in: FEMS Microbiology Ecology. 1 S.

  Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

  Open Access

• Tissue specificity of plant microbiomes and the role of seed-associated microbiota

  Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), Mitter, B. (Autor:in, eingeladen), Escobar-Rodríguez, C. (Autor:in, eingeladen), Pfaffenbichler, N. (Autor:in, eingeladen), Compant, S. (Autor:in, eingeladen), Antonielli, L. (Autor:in, eingeladen) & Trognitz, F. (Autor:in, eingeladen), 2016, Programm Book 2016 IS-MPMI. 1 S.

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• 2015

  Biological control of the allergen producer common ragweed (Ambrosia artemisiifolia)

  Widhalm, S. (Vortragende:r), Sessitsch, A. & Trognitz, F., 2015, abstract book. S. 739 1 S.

  Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation

• Development of high througput methods for the detection of hydrogen cyanide producing bacteria for the application in biocontrol

  Dürr, S. (Vortragende:r), Sessitsch, A., Brader, G. & Trognitz, F., 2015, abstract book. S. 24-26 3 S.

  Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation

• From lab to field: Burkholderia phytofirmans PsJN genome analysis and applications to reduce plant stress

  Mitter, B. (Autor:in, Hauptvortrag), Naveed, M. (Autor:in, Hauptvortrag), Touceda-Gonzales, M. (Autor:in, Hauptvortrag), Tezerji Sheibani, R. (Autor:in, Hauptvortrag), Trognitz, F. (Autor:in, Hauptvortrag) & Sessitsch, A. (Vortragende:r, Hauptvortrag), 2015, abstract book PGPR Workshop. 1 S.

  Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband

• Genotype-dependent interaction with beneficial plant associated bacteria

  Trognitz, F. (Vortragende:r), Mayerhof, H., Mitter, B. & Sessitsch, A., 2015, abstract book. S. 25 1 S.

  Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband