Ivan Barisic

2024

Comparison of two peroxidases with high potential for biotechnology applications – HRP vs. APEX2

Škulj, S., Kožić, M., Barišić, A., Vega, A., Biarnés, X., Piantanida, I., Barisic, I. & bertosa, B., 12 Jan. 2024, in: Computational and Structural Biotechnology Journal. 23, S. 742-751 10 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

DNA origami-enhanced binding of aptamers to Staphylococcus aureus cells

Ahmadi, Y., Umrekar, T. R., Mutter, N., Beeby, M. & Barišić, I., 5 Jan. 2024, in: Biosensors and Bioelectronics: X.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Treated municipal wastewater as a source of high-risk and emerging multidrug-resistant clones of E. coli and other Enterobacterales producing extended-spectrum β-lactamases

Puljko, A., Babić, I., Rozman, S. D., Barisic, I., Jelić, M., Maravić, A., Parać, M., Petrić, I. & Udiković-Kolić, N., 15 Feb. 2024, in: Environmental Research. 243, S. 117792 11 S., 117792.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

2023

Application of Antimicrobial Peptides as Diagnostic Biosensors: Analytical Chemistry

Ahmadi, Y., Savini, F., Mutter, N. & Barišić, I., 19 Dez. 2023, in: Analytical Chemistry. 96, 1, S. 256-264 9 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

A Simple Biosensor Based on Streptavidin-HRP for the Detection of Bacteria Exploiting HRPs Molecular Surface Properties

Savini, F., Mutter, N., Baumgartner, K. & Barišić, I., 19 Sept. 2023, in: Applied Biosciences.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Bio-nanoengineering to detect and antagonize multidrug-resistant pathogens

Barisic, I., 28 Aug. 2023, 253 S.

Publikation: Abschlussarbeit › Habilitation

Highly selective preparation of N-terminus Horseradish peroxidase-DNA conjugate with fully retained enzymatic activity: HRP-DNA structure - activity relation

Ban, Ž., Barišić, A., Crnolatac, I., Kazazić, S., Škulj, S., Savini, F., Bertoša, B., Barisic, I. & Piantanida, I., Aug. 2023, in: Enzyme and Microbial Technology. 168, 11 S., 110257.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

MICROBE SYNTHESISED DNA FOR DNA-BASED DATA STORAGE

Barisic, I. (Vortragende:r), Sept. 2023.

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Multidrug-Resistant Bacteria in a COVID-19 Hospital in Zagreb

Bedenić, B., Bratić, V., Mihaljević, S., Lukić, A., Vidović, K., Reiner, K., Schöenthaler, S., Barišić, I., Zarfel, G. & Grisold, A., 10 Jan. 2023, in: Pathogens. 12, 1, 15 S., 117.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Resistance to critically important antibiotics in hospital wastewater from the largest Croatian city

Puljko, A., Rozman, S. D., Barisic, I., Maravić, A., Jelić, M., Babić, I., Milaković, M., Petrić, I. & Udiković-Kolić, N., 20 Apr. 2023, in: Science of the Total Environment. 870, S. 161805 13 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Virulence Factor Genes in Invasive Escherichia coli Are Associated with Clinical Outcomes and Disease Severity in Patients with Sepsis: A Prospective Observational Cohort Study

D'Onofrio, V., Cartuyvels, R., Messiaen, P. E. A., Barišić, I. & Gyssens, I. C., 17 Juli 2023, in: Microorganisms. 11, 7, 16 S., 1827.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

2022

A Variant Carbapenem Inactivation Method (CIM) for #lti#gtAcinetobacter baumannii#lt/i#gt Group with Shortened Time-to-Result: rCIM-A.

Mitteregger, D., Wessely, J., Barisic, I., Bedenic, B., Kosak, D. & Kundi, M., 2022, in: Pathogens.. 11, 4, S. 482 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

CATANA: an online modelling environment for proteins and nucleic acid nanostructures

Kutak, D., Melo, L., Schroeder, F., Jelic-Matosevic, Z., Mutter, N., Bertosa, B. & Barisic, I., 2022, in: Nucleic Acids Research. 1, 1, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Causative agents of bloodstream infections in two Croatian hospitals and their resistance mechanisms

Bedenic, B., Likic, S., Zizek, M., Bratic, V., D´Onofrio, V., Cavric, G., Vodanovic, M. & Barisic, I., 2022, in: Journal of Chemotherapy. 1, 1, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Diffusion of OXA-48 carbapenemase among urinary isolates of Klebsiella pneumoniae in non-hospitalized elderly patients

Suto, S., Bedenic, B., Likic, S., Anusic, M., Ticic, V., Zarfel, G., Grisold, A., Barisic, I. & Vranes, J., 2022, in: BMC Microbiology. 1, 30, S. 649 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Effect of N-glycosylation on Horseradish Peroxidase Structural and Dynamical Properties

Skulj, S., Barisic, A., Mutter, N., Spadiut, O., Barisic, I. & Bertosa, B., 2022, in: Computational and Structural Biotechnology Journal. 1, 1, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Evolution of Beta-Lactamases in Urinary Klebsiella pneumoniae Isolates from Croatia; from Extended-Spectrum Beta-Lactamases to Carbapenemases and Colistin Resistance

Bedenic, B., Peorda, L., Krilanovic, M., Beader, N., Veir, Z., Schönthaler, S., Bandic-Pavlovic, D., Frančula-Zaninović, S. & Barisic, I., 2022, in: Current Microbiology. 79, 355, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Rolling Circle Amplifiaction Tailored for Plasmonic Biosensors

Schmidt, K., Lechner, B., Hageneder, S., Fossati, S., Ahmadi, Y., Minunni, M., Reimhult, E., Barisic, I. & Dostalek, J. (Vortragende:r), 2022, SPIE Biophotonics in Point-of-Care II. 1 S.

Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband › Begutachtung

Open Access

Rolling Circle Amplification Tailored for Plasmonic Biosensors: From Ensemble to Single-Molecule Detection

Schmidt, K., Hageneder, S., Lechner, B., Zbiral, B., Fossati, S., Ahmadi, Y., Minunni, M., Reimhult, E., Barisic, I. & Dostalek, J., 2022, in: ACS applied materials & interfaces. 14, 49, S. 55017-55027 11 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Unified Nanotechnology Format: One Way to Store Them All

Kutak, D., Poppleton, E., Miao, H., Sulc, P. & Barisic, I., 2022, in: Molecules. 27, 1, S. 63 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

2021

: Full pathogen characterisation: species identification including the detection of virulence factors and antibiotic resistance genes via multiplex DNA-assays

Wolff, N., Hendling, M., Schroeder, F., Schönthaler, S., Geiss, A., Branka, B. & Barisic, I., 2021, in: Scientific Reports. 11, 1, S. 6001 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Analysing criteria affecting the functionality of GQ-based DNA aptazymes as colorimetric biosensors and development of quinine-binding aptazymes

Ahmadi, Y. (Vortragende:r), Soldo, R., Rathammer, K., Eibler, L. & Barisic, I., 2021.

Publikation: Posterpräsentation ohne Beitrag in Tagungsband › Posterpräsentation ohne Eintrag in Tagungsband

Analysing criteria affecting the functionality of G-quadruplex-based DNA aptazymes as colorimetric biosensors and development of quinine-binding aptazymes

Ahmadi, Y., Soldo, R., Rathammer, K., Eibler, L. & Barisic, I., 2021, in: Biosensors - Basel. 12, 93, S. 5161-5169 9 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Bithiophene-Cored, mono-, bis-, and tris- (Trimethylammonium)-Substituted, bis-Triarylborane Chromophores: Effect of the Number and Position of Charges on Cell Imaging and DNA/RNA Sensing

Berger, S., Rühe, J., Schwarzmann, J., Phillipps, A., Richard, A.-K., Ferger, M., Krummenacher, I., Tumir, L.-M., Ban, Z., Crnolatac, I., Majhen, D., Barisic, I. & Piantanida, I., 2021, in: Chemistry-A European Journal. 1, 1, S. 14057-14072 16 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Computational Design of Multiplex Oligonucleotide-Based Assays

Hendling, M., Barisic, I. & Barisic, I., 2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). Springer, Band 2189. S. 19-30 12 S.

Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Buchkapitel

Open Access

In situ monitoring of rolling-circle amplification on a solid support by surface plasmon resonance and optical waveguide spectroscopy

Lechner, B., Hageneder, S., Schmidt, K., Kreuzer, M. P., Conzemius, R., Reimhult, E., Barisic, I. & Dostalek, J., 2021, in: ACS applied materials & interfaces. 13, 27

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Padlock Probe-Based Generation of DNAzymes for the Colorimetric Detection of Antibiotic Resistance Genes

Conzemius, R., Haunold, A. & Barisic, I., 2021, in: International Journal of Molecular Sciences. 24, 22, S. 13654 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

ResiDB: An automated database manager for sequence data

Hendling, M., Conzemius, R. & Barisic, I., 2021, in: Computational and Structural Biotechnology Journal. 19, 1, S. 847-851 5 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Vivern - A Virtual Environment for Multiscale Visualization and Modeling of DNA Nanostructures

Kutak, D., Nicolas, M., Byska, J., Ganuza, M. L., Barisic, I., Kozlíková, B. & Miao, H., 2021, in: IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 1, 1, S. 1-14 14 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

2020

Adenita: interactive 3D modelling and visualization of DNA nanostructures

DeLIano, E., Haichao, M., Ahmadi, Y., Wilson, A., Beeby, M. & Barisic, I., 2020, in: Nucleic Acids Research. 1, 1, S. 1362 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Assessment of Human Health Risks Posed by Nano-and Microplastics Is Currently Not Feasible

Brachner, A., Fraqouli, D., Duarte, I. F., Farias, P. M. A., Dembski, S., Ghosh, M., Barisic, I., Zdzieblo, D., Vanoirbeek, J., Schwabl, P. & Neuhaus, W., 2020, in: International Journal of Environmental Research and Public Health. S. 1-10 10 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Crosslinking of PCR primers reduces unspecific amplification products in multiplex PCR

Wolff, N., Geiss, A. & Barisic, I., 2020, in: Journal of Microbiological Methods. 178, 106051, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Epidemiology of colistin-resistant, carbapenemase-producing Enterobacteriaceae and Acinetobacter baumannii in Croatia

D´Onofrio, V., Conzemius, R., Varda-Brkić, D., Gyssens, I., Grisold, A., Bedenić, B. & Barisic, I., 2020, in: Infection, Genetics and Evolution. 1, 1, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

ESBL Types and Plasmid Heterogeneity in Urinary E. coli Isolates: Results From a Nationwide Multicenter Study in Croatia

Mestrovic, T., Krilanovic, M., Tomic-Paradzik, M., Beader, N., Herljevic, Z., Conzemius, R., Barisic, I., Vranes, J., Elvedi-Gasparovic, V. & Bedenic, B., 2020, in: Infection Control and Hospital Epidemiology. 41, S. 63-64 2 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Extended-spectrum beta-lactamases and plasmid diversity in urinary isolates of Escherichia coli in Croatia: a nation-wide, multicentric, retrospective study

Krilanović, M., Paradzik, T., Mestrović, T., Beader, N., Herljević, Z., Conzemius, R., Barisic, I., Vranes, J., Elveđi-Gasparović, V. & Bedenic, B., 2020, in: Folia Microbiologica. 1, 1, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

In silico modelling of DNA nanostructures

Kekic, T. & Barisic, I., 2020, in: Computational and Structural Biotechnology Journal. 18, 18, S. 1191-1201 11 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

The Brownian and Flow-Driven Rotational Dynamics of a Multicomponent DNA Origami-Based Rotor

Ahmadi, Y., Wilson, A., Huetter, C., Schroeder, F., Beeby, M., Barisic, I. & Nord, A., 2020, in: Small. 16, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

The Clinical Impact of Rapid Molecular Microbiological Diagnostics for Pathogen and Resistance Gene Identification in Patients With Sepsis: A Systematic Review

D´Onofrio, V., Lene, S., Branka, B., Cartuyvels, R., Barisic, I. & Inge C., G., 2020, in: Open Forum Infectious Diseases. 7, 10, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

2019

Gene-therapy Inspired Polycation Coating for Protection of DNA Origami Nanostructures

Barisic, I. & Ahmadi, Y., 2019, in: JOVE. 143, 143, S. 1-2 2 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

HRP-mimicking based DNA aptazymes in diagnostics: Top or flop?

Ahmadi, Y. (Vortragende:r), Rathammer, K., Soldo, R. & Barisic, I., 2019.

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In-silico Design of DNA Oligonucleotides: Challenges and Approaches

Hendling, M. & Barisic, I., 2019, in: Computational and Structural Biotechnology Journal. 17, 17, 9 S.

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Open Access

Interactive Exploded Views for Molecular Structures

Sbardellati, M. (Vortragende:r, eingeladen), Miao, H. (Autor:in, eingeladen), Wu, H. (Autor:in, eingeladen), Gröller, E. (Autor:in, eingeladen), Barisic, I. (Autor:in, eingeladen) & Viola, I. (Autor:in, eingeladen), 2019, Proceedings of the 9th Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine. S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband › Begutachtung

Open Access

Interactive Visual Analysis for the Design of DNA Nanostructures

Miao, H. (Vortragende:r), DeLIano, E., Viola, I. & Barisic, I., 2019.

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Low-Cost Microarray platform to detect antibiotic resistance genes

Wolff, N., Hendling, M., Schönthaler, S., Geiss, A., Barisic, I. & Andreas, F., 2019, in: Sensing and Bio-Sensing Research 23. 23, S. 1 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

PRIMEval: Optimization and screening of multiplex oligonucleotide assays

Conzemius, R., Hendling, M., Pabinger, S. & Barisic, I., 2019, in: Scientific Reports. 9, 19286, 1 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung

Open Access

Ultraplex DNA-based detection of 809 clinically relevant antibiotic resistance genes and virulence factors on a ligase-dependent microarray chip

Wolff, N. (Vortragende:r, eingeladen), Hendling, M. (Autor:in, eingeladen ) & Barisic, I. (Autor:in, eingeladen ), 2019.

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2018

Ivan Barisic

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