Klemens Vierlinger

Suchergebnisse

• 2024

  Predicting Outcomes of Preterm Neonates Post Intraventricular Hemorrhage

  Vignolle, G. A., Bauerstätter, P., Schönthaler, S., Nöhammer, C., Olischar, M., Berger, A., Kasprian, G., Langs, G., Vierlinger, K. & Goeral, K., 25 Sept. 2024, in: International Journal of Molecular Sciences.

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  • Cerebral Hemorrhage 100%
  • Intraventricular Hemorrhage 100%
  • Clinical Decision Making 20%
  • Protein 20%
  • Neurofilament Light Chain 20%

• Proceedings of the 15th International Newborn Brain Conference: Other forms of brain monitoring, such as NIRS, fMRI, biochemical, etc. Fota Island, Cork, Ireland, February 28th – March 2nd 2024: Machine learning predicts outcomes in preterm neonates with intraventricular hemorrhage using targeted proteomics

  Schöntaler, S., Nöhammer, C., Olischar, M., Berger, A., Kasprian, G., Langs, G., Vierlinger, K., Nicoletti, N., Lavu, R., Liu, W., Karnati, S., Puthuraya, S., Turner, H. L., Boardman, J. P., Robertson, N. J., Pradas, A. L., Schwaberger, B., Pichler, G. & El-Dib, M. &3 mehr, Goldstein, S., Sunwoo, J. & Schlatterer, S., 5 Aug. 2024, in: Journal of Neonatal-Perinatal Medicine. 17, S. S393-S394 2 S., 1.

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  Open Access

  • Proteomics 100%
  • Decision Making 33%
  • Dilatation 33%
  • High Risk Population 33%
• 2023

  Antibody Profiling and In Silico Functional Analysis of Differentially Reactive Antibody Signatures of Glioblastomas and Meningiomas

  Milchram, L., Kulovics, R., Sonntagbauer, M., Schönthaler, S., Vierlinger, K., Dorfer, C., Cameron, C., Saydam, O. & Weinhäusel, A., 11 Jan. 2023, in: International Journal of Molecular Sciences. 24, 2, 22 S.

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  Open Access

  • Meningioma 100%
  • Platelet 50%
  • Tumor Antigen 50%
  • Degranulation 50%
  • Intravenous Immunoglobulin 50%

• Patients with Systemic Juvenile Idiopathic Arthritis (SJIA) Show Differences in Autoantibody Signatures Based on Disease Activity

  Krainer, J., Hendling, M., Siebenhandl, S., Fuehner, S., Kessel, C., g, E., Vierlinger, K., Foell, D., Schönthaler, S. & Weinhäusel, A., 15 Sept. 2023, in: Biomolecules. 13, 9

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  Open Access

  • Autoantibodies 100%
  • Juvenile Idiopathic Arthritis 100%
  • Rheumatic Disease 28%
  • Inflammatory Arthritis 14%
  • Arthropathy 14%

• Targeting epigenetic features in clear cell sarcomas based on patient-derived cell lines

  Karner, C., Anders, I., Vejzovic, D., Szkandera, J., Scheipl, S., Deutsch, A. J. A., Weiss, L., Vierlinger, K., Kolb, D., Kühberger, S., Heitzer, E., Habisch, H., Zhang, F., Madl, T., Reininger-Gutmann, B., Liegl-Atzwanger, B. & Rinner, B., 29 Jan. 2023, in: Journal of Translational Medicine. 21, 19 S., 54.

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  Open Access

  • Epigenomics 100%
  • Cell Line 100%
  • Clear-Cell Sarcoma 100%
  • Therapeutic Procedure 60%
  • Fibroblast 60%
• 2022

  Circulating serum microRNAs including senescent miR-31-5p are associated with incident fragility fractures in older postmenopausal women with type 2 diabetes mellitus

  Heilmeier, U., Hackl, M., Schroeder, F., Torabi, S., Kapoor, P., Vierlinger, K., Eiriksdottir, G., Harris, T., Gudnason, V., Link, T., Grillari, J. & Schwartz, A., 2022, in: Bone. 158, 1, S. 116308 1 S.

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  Open Access

• Designed SARS‐CoV‐2 receptor binding domain variants form stable monomers

  Klausberger, M., Laurent, E., Stadlbauer, K., Vierlinger, K., Hofner, M., Gerner, W., Grebien, F., Kienzl, N., Stadlmayr, G., Grünwald-Gruber, C., Stracke, F., Manhart, M., Weinhäusel, A., Mach, L. & Wozniak Knopp, G., 2022, in: Biotechnology Journal. 1, 1, S. 1 1 S.

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  Open Access

• Functional Analysis of Autoantibody Signatures in Rheumatoid Arthritis

  Milchram, L., Fischer, A., Sieghart, D., Vierlinger, K., Blüml, S., Huber, J., Soldo, R., Steiner, G. & Weinhäusel, A., 2022, in: Molecules. 27, 4, S. 1452 1 S.

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  Open Access

• In Planta Production of the Receptor-Binding Domain From SARS-CoV-2 With Human Blood Group A Glycan Structures

  König-Beihammer, J., Vavra, U., Shin, Y.-J., Veit, C., Grünwalder-Gruber, C., Gillitschka, Y., Huber, J., Hofner, M., Vierlinger, K., Mitteregger, D., Weinhäusel, A. & Strasser, R., 2022, in: Frontiers in Chemistry. 9, 9, S. 1 1 S.

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• 2021

  A Comprehensive Antigen Production and Characterisation Study for Easy-to-Implement, Specific and Quantitative SARS-CoV-2 Serotests

  Klausberger, M., Dürkop, M., Haslacher, H., Wozniak Knopp, G., Puschmann, M., Perkmann, T., Vierlinger, K. & Weinhäusel, A., 2021, in: eBioMedicine. 67, 103348, S. 1 1 S.

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  Open Access

• Expression Profiling Suggests Loss of Surface Integrity and Failure of Regenerative Repair as Major Driving Forces for COPD Progression

  Samaha, E., Vierlinger, K., Weinhappel, W., Godnic-Cvar, J., Nöhammer, C., Koczan, D., Thiesen, H.-J., Yanai, H., Fraifeld, V. & Ziesche, R., 2021, in: American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 1, 1, S. 1 1 S.

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  Open Access

• Impact of Specific N-Glycan Modifications on the Use of Plant-Produced SARS-CoV-2 Antigens in Serological Assays

  Schwestka, J., König-Beihammer, J., Vavra, U., Grünwald-Gruber, C., Maresch, O., Klausberger, M., Manhart, M., Huber, J., Hofner, M., Vierlinger, K., Weinhäusel, A., Swoboda, I., Binder, C. J., Gerner, W., Grebien, F., Altmann, F., Mach, L., Stöger, E. & Strasser, R., 2021, in: Frontiers in Plant Science. 1, 1, S. 1 1 S.

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  Open Access

• N-Glycosylation of the SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain Is Important for Functional Expression in Plants

  Shin, Y.-J., König-Beihammer, J., Vavra, U., Schwestka, J., Kienzl, N., Klausberger, M., Laurent, E., Grünwald-Gruber, C., Vierlinger, K., Hofner, M., Weinhäusel, A., Stöger, E., Mach, L. & Strasser, R., 2021, in: Frontiers in Plant Science. 1, 1, S. 1 1 S.

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  Open Access

• Random rotation for identifying differentially expressed genes with linear models following batch effect correction

  Hettegger, P., Vierlinger, K. & Weinhäusel, A., 2021, in: Bioinformatics. 1, S. 1 1 S.

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  Open Access
• 2020

  Gene expression profiling identifies pathways involved in seed maturation of Jatropha curcas

  Vierlinger, K., 2020, in: BMC Genomics. 21, S. 290 1 S.

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  Open Access
• 2019

  EPIC-TABSAT: analysis tool for targeted bisulfite sequencing experiments and array-based methylation studies

  Krainer, J., Weinhäusel, A., Hanak, K., Pulverer, W., Özen, S., Vierlinger, K. & Pabinger, S., 2019, in: Nucleic Acids Research. 1, 4, S. 1 1 S.

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  Open Access
• 2017

  Ape1 guides DNA repair pathway choice that is associated with drug tolerance in glioblastoma.

  Ströbel, T., Madlener, S., Tuna, S., Vose, S., Langerwerij, T., Wurdinger, T., Vierlinger, K., Wöhrer, A., Price, B., Demple, B., Saydam, O. & Saydam, N., 2017, in: Scientific Reports. 7, 1, S. 9674 1 S.

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• Middle age enhances expression of innate immunity genes in a female mouse model of pulmonary fibrosis.

  Golec, M., Wielscher, M., Lemieszek, M., Vierlinger, K., Skórska, C., Hütter, S., Sitkowska, J., Mackiewicz, B., Góra-Florek, A., Ziesche, R., Yanai, H., Fraifeld, V., Milanowski, J. & Dutkiewicz, J., 2017, in: Biogerontology. 18, 2, S. 253-262 10 S.

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• New liver cancer biomarkers: PI3K/AKT/mTOR pathway members and eukaryotic translation initiation factors

  Golob-Schwarzl, N., Krassnig, S., Töglhofer, A., Park, Y., Gogg-Kamerer, M., Vierlinger, K., Schröder, F., Rhee, H., Schicho, R., Fickert, P. & Haybaeck, J., 2017, in: European Journal of Cancer. 83, 9, S. 56-70 15 S.

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• 2016

  Analysis and Visualization Tool for Targeted Amplicon Bisulfite Sequencing on Ion Torrent Sequencers

  Pabinger, S., Ernst, K., Pulverer, W., Kallmeyer, R., Ana, M., Metrustry, S., Katic, D., Nuzzo, A., Kriegner, A., Vierlinger, K. & Weinhäusel, A., 2016, in: PLoS ONE. 1, S. 1 1 S.

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• Serum miRNA Signatures Are Indicative of Skeletal Fractures in Postmenopausal Women With and Without Type 2 Diabetes and Influence Osteogenic and Adipogenic Differentiation of Adipose Tissue-Derived Mesenchymal Stem Cells In Vitro.

  Heilmeier, U., Hackl, H., Skalicky, S., Weilner, S., Schroeder, F., Vierlinger, K., Patsch, J., Baum, T., Oberbauer, E., Lobach, I., Burghardt, H., Schwartz, A., Grillari, J. & Link, T. I., 2016, in: Bone. S. 2173-2192 20 S.

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• The prostate cancer immunome: In silico functional analysis of antigenic proteins from microarray profiling with IgG

  Luna-Coronell, J. A., Vierlinger, K., Gamperl, M., Hofbauer, J., Berger, I. & Weinhäusel, A., Apr. 2016, in: Proteomics. 16, 8, S. 1204-14 11 S.

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  • Escherichia coli 100%
  • Protein P53 28%
  • Gleason Score 28%
  • Tumor-Related Gene 28%
  • Cell Death 20%

• The Prostate Cancer Immunome: In Silico Functional Analysis of Antigenic Proteins from Microarray Profiling with IgG

  Luna-Coronell, J., Vierlinger, K., Gamperl, M., Hofbauer, J., Berger, I. & Weinhäusel, A., 2016, in: Journal of Proteomics. 1, S. 1 1 S.

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• 2015

  Epigenetic profile of human adventitial progenitor cells correlates with therapeutic outcomes in a mouse model of limb ischemia.

  Gubernator, M., Slater, S., Spencer, M., Spiteri, I., Sottoriva, A., Piu, F., Rowlinson, J., Avolio, E., Katare, R., Mangialardi, G., Oikawa, A., Reni, C., Campagnolo, P., Spinetti, G., Touloumis, A., Proandi, F., Pesce, M., Hofner, M., Vierlinger, K. & Emanueli, C. &2 mehr, Angelini, G. & Madeddu, P., 2015, in: Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. 35, 3, S. 675-688 14 S.

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• Multiplex characterisation of human pathogens including species and antibiotic resistance gene identification

  Barisic, I., Petzka, J., Schönthaler, S., Vierlinger, K., Nöhammer, C. & Wiesinger-Mayr, H., 2015, in: Journal of Medical Microbiology.

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• Wound healing and longevity: lessons from long-lived aMUPA mice

  Yanai, H., Toren, D., Vierlinger, K., Hofner, M., Nöhammer, C., Chilosi, M., Budovsky, A. & Fraifeld, V., 2015, in: Aging. 7, 3, S. 167-176 10 S.

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• 2014

  A survey of tools for the analysis of quantitative PCR (qPCR) data

  Pabinger, S., Rödiger, S., Kriegner, A., Vierlinger, K. & Weinhäusel, A., 2014, in: Biomolecular Detection and Quantification. 1, 1, S. 23-33 11 S.

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• Human blood monocytes support persistence, but not replication of the intracellular pathogen C. pneumoniae.

  Buchacher, T., Wiesinger-Mayr, H., Vierlinger, K., Rüger, B., Stanek, G., Fischer, M. & Weber, V., 2014, in: BMC Immunology. 15, 60, 1 S.

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• Increased Antioxidant Defense Mechanism in Human Adventitia-Derived Progenitor Cells Is Associated with Therapeutic Benefit in Ischemia

  Iacobazzi, D., Mangialardi, G., Hofner, M., Wielscher, M., Vierlinger, K., Reni, C., Oikawa, A., Spinetti, G., Vono, R., Sangalli, E., Montagnani, M. & Madeddu, P., 2014, in: Antioxidants & Redox Signaling. 1 S.

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• Strategies for validation and testing of DNA methylation biomarkers.

  Nöhammer, C., Pulverer, W., Hassler, M., Hofner, M., Wielscher, M., Vierlinger, K., Liloglou, T., McCarthy, D., Jensen, T., Nygren, A., Trooskens, G., Gohlke, H., Braspenning, M., Van Criekinge, W., Egger, G. & Weinhäusel, A., 2014, in: Epigenomics. 6, 6, S. 603-622 20 S.

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• 2013

  Age influence on hypersensitivity pneumonitis induced in mice by exposure to Pantoea agglomerans

  Lemieszek, M., Chilosi, M., Golec, M., Skórska, C., Dinnyes, A., Mashayekhi, K., Vierlinger, K., Huaux, F., Wielscher, M., Hofner, M., Yakoub, Y., Pastena, C., Daniele, I., Cholewa, G., Sitkowska, J., Lisowska, W., Zwoliński, J., Milanowski, J., Mackiewicz, B. & Góra-Florek, A. &2 mehr, Ziesche, R. & Dutkiewicz, J., 2013, in: Inhalation Toxicology. 25, S. 640-650 11 S.

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• 2012

  Evaluation of auto-antibody serum biomarkers for breast cancer screening and in silico analysis of sero-reactive proteins.

  Syed, P., Vierlinger, K., Kriegner, A., Sergelen, K., Rappaport, C., Nöhammer, C., Singer, C. F., Weinhäusel, A. & Luna-Coronell, J., 2012, in: Journal of Molecular Biochemistry. 1, S. 116-128 13 S.

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• In silico design and performance of peptide microarrays for breast cancer tumour auto-antibody testing

  Syed, P., Gyurjan, I., Kriegner, A., Vierlinger, K., Singer, C. F., Rappaport, C., Zerweck, J., Söllner, J. & Weinhäusel, A., 2012, in: Journal of Molecular Biochemistry. 1, 1, S. 129-143 15 S.

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• speedR: An R Package for Interactive Data Import, Filtering and Ready-to-Use Code Generation

  Visne, I., Dilaveroglu, E., Yildiz, A., Vierlinger, K., Nöhammer, C., Leisch, F. & Kriegner, A., 2012, in: Journal of Statistical Software. 1 S.

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• "The stem cell signature of CHH/CHG methylation is not present in 271 cancer associated 5´UTR gene regions"

  Pulverer, W., Wielscher, M., Panzer-Grünmayer, R., Plessl, T., Kriegner, A., Vierlinger, K. & Weinhäusel, A., 2012, in: Biochimie. 94, S. 2345-2352 8 S.

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• 2011

  Identification of SERPINA1 as single marker for papillary thyroid carcinoma

  Vierlinger, K., Mansfeld, M., Koperek, O., Nöhammer, C., Kaserer, K. & Leisch, F., 2011, in: BMC Med Genomics. 9 S.

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  Open Access
• 2010

  Tumour auto-antibody screening: performance of protein microarrays using SEREX derived antigens

  Stempfer, R., Syed, P., Vierlinger, K., Pichler, R., Meese, E., Leidinger, P., Ludwig, N., Kriegner, A., Nöhammer, C. & Weinhäusel, A., 2010, in: BMC Cancer. 1 S.

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• 2009

  Gene expression studies in cultured dendritic cells: new indicators for the discrimination of skin sensitizers and irritants in vitro

  Szameit, S., Vierlinger, K., Farmer, L., Tuschl, H. & Nöhammer, C., 2009, in: Clinical and Experimental Allergy. 39, 6, S. 856-868 13 S.

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• RGG: A general GUI Framework for R scripts

  Visne, I., Dilaveroglu, E., Vierlinger, K., Lauss, M., Yildiz, A., Weinhäusel, A., Nöhammer, C., Leisch, F. & Kriegner, A., 2009, in: BMC Bioinformatics. 10, 74, 1 S.

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• 2008

  Aberrant methylation evidence in human cancer

  Lauss, M., Visne, I., Weinhäusel, A., Vierlinger, K., Nöhammer, C. & Kriegner, A., 2008, in: MethCancerDB.

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  • Genomics 100%
  • Guanine 100%
  • CpG Island 100%
  • Cytosine 100%

• MethCancer DB - aberrant DNA methylation in human cancer

  Lauss, M., Visne, I., Weinhäusel, A., Vierlinger, K., Nöhammer, C. & Kriegner, A., 2008, in: British Journal of Cancer. 98, 4, S. 816-817 2 S.

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• Microarray-Based In Vitro Test System for a Discrimination of Contact Allergens and Irritants: Identification of Potential Marker Genes

  Szameit, S., Vierlinger, K., Farmer, L., Tuschl, H. & Nöhammer, C., 2008, in: Clinical Chemistry. 54, 3, S. 525-533 9 S.

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• The Influence of Gender, Age, and RET Polymorphisms on C-Cell Hyperplasia and Medullary Thyroid Carcinoma

  Weinhäusel, A., Scheuba, C., Lauss, M., Kriegner, A., Kaserer, K., Vierlinger, K., Haas Oskar, A. & Niederle, B., 2008, in: Thyroid. 18, 12, S. 1269-1276 8 S.

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• 2007

  Accurate Identification of human pathogens isolated from blood using microarray hybridisation and signal pattern recognition

  Wiesinger-Mayr, H., Vierlinger, K., Pichler, R., Kriegner, A., Hirschl Alexander, M., Presterl, E., Bodrossy, L. & Nöhammer, C., 2007, in: BMC Microbiology. S. 1-51 51 S.

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• Characterization of the drugged human genome

  Lauss, M., Kriegner, A., Vierlinger, K. & Nöhammer, C., 2007, in: Pharmacogenomics. 8, S. 1063-1073 11 S.

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• Comparison of RNA Amplification Techniques meeting the demands for the Expression Profiling of Clinical Cancer Samples

  Lauss, M., Vierlinger, K., Weinhäusel, A., Szameit, S., Kaserer, K. & Nöhammer, C., 2007, in: Virchows Archiv. 2, S. 1019-1029 11 S.

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• Consensus genes of the literature to predict breast cancer recurrence

  Lauss, M., Kriegner, A., Vierlinger, K., Visne, I., Yildiz, A., Dilaveroglu, E. & Nöhammer, C., 2007, in: Breast Cancer Res. Treat. S. 1-10 10 S.

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• Identification of human pathogens isolated from blood using microarray hybridisation and signal pattern recognition

  Wiesinger-Mayr, H., Vierlinger, K., Pichler, R., Kriegner, A., Hirschl Alexander, M., Presterl, E., Bodrossy, L. & Nöhammer, C., 2007, in: BMC Microbiology. S. 1-51 51 S.

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  • Human Pathogen 100%
  • Infectious Agent 100%
  • Morphology 100%
  • Pattern Recognition 100%
  • Microorganism 100%
• 2005

  Transcriptonal analysis of varicella-zoster virus infection using long oligonucleotide-based microarrays.

  Kennedy, P., Grinfeld, E., Craigon, M., Vierlinger, K., Roy, D., Forster, T. & Ghazal, P., 2005, in: Journal of General Virology. S. 84-2673 2590 S.

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