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2024
Análisis del microbioma rizosférico como indicador del estado fitosanitario en olivares afectados por Verticilosis en Andalucía
Arias-Giraldo, L. F., Antonielli, L., Compant, S., Navas-Cortés, J. A. & Landa, B. B., 16 Sept. 2024, abstract book XXI congreso de la SEF.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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BacFlux: A workflow for bacterial short reads assembly, QC, annotation, and more
Antonielli, L. (Entwickler:in), Großkinsky, D. K. (Entwickler:in), Koch, H. (Entwickler:in), Trognitz, F. (Entwickler:in), Sanchez Mejia, A. (Entwickler:in) & Nagel, M. (Entwickler:in), 2024Publikation: Software › Open Source-Software
Open Access -
BacFluxL: A workflow for genomic analysis of bacterial long reads
Antonielli, L. (Entwickler:in), Koch, H. (Entwickler:in), Trognitz, F. (Entwickler:in), Nagel, M. (Entwickler:in), Sanchez Mejia, A. (Entwickler:in) & Großkinsky, D. K. (Entwickler:in), 2024Publikation: Software › Open Source-Software
Open Access -
BacFluxL+: Bacterial genome analysis using short and long reads
Antonielli, L. (Entwickler:in), Nagel, M. (Entwickler:in), Sanchez Mejia, A. (Entwickler:in), Koch, H. (Entwickler:in), Trognitz, F. (Entwickler:in) & Großkinsky, D. K. (Entwickler:in), 2024Publikation: Software › Open Source-Software
Open Access -
Bacteria-fungi interactions and impacts on plant growth and health
Wallner, A., Verma, S. K., Kiss, T., del Barrio Duque, A., Antonielli, L., Sessitsch, A. & Compant, S. (Vortragende:r), 1 Juli 2024, abstract book ippcathens2024.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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FunFlux: Integrated workflow for fungal genome assembly and annotation.
Antonielli, L. (Entwickler:in), Brader, G. (Entwickler:in) & Compant, S. (Entwickler:in), Aug. 2024Publikation: Software › Open Source-Software
Open Access -
Genomic diversity in <i>Paenibacillus polymyxa</i> unveiling distinct species groups and functional variability
Wallner, A., Antonielli, L., Mesguida, O., Rey, P. & Compant, S., 25 Juli 2024, in: BMC Genomics. 25, 1, 11 S., 720.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Genomic diversity in Paenibacillus polymyxa: Unveiling distinct species groups and functional variability
Wallner, A., Antonielli, L., Mesguida, O., Rey, P. & Compant, S., 26 März 2024Publikation: Andere Beiträge › Sonstiger Beitrag › Begutachtung
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Harnessing fungal-bacterial interactions to improve plant growth and health
Wallner, A., Verma, S. K., Kiss, T., del Barrio Duque, A., Antonielli, L., Sessitsch, A. & Compant, S. (Vortragende:r, eingeladen), 2024, FROM BIOTECHNOLOGY TO HUMAN AND PLANETARY HEALTH XIII CONGRESS OF MICROBIOLOGISTS OF SERBIA book of abstracts. for Microbiolog, S. S. (Hrsg.). SerbienPublikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Harnessing machine learning for predictive tools in microbiome studies: a focus on amplicon sequence variants and metagenomic shotgun sequencing
Antonielli, L. (Vortragende:r, eingeladen), Carlino, N., Segata, N., Sessitsch, A., Carolina Escobar, R. & Kostic, T., 2024, abstract book miCROPe.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
Open Access -
Insight into the bacterial and fungal above- and below-ground communities of the Taggiasca olive tree variety through a metabarcoding approach
Traina, C., Antonielli, L., Ley, J. M., Kostic, T. & Cocolin, L., 2024, abstract book miCROPe 2024.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation
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MICROBE-ASSISTED CROP PRODUCTION – OPPORTUNITIES, CHALLENGES & NEEDS
Wallner, A., Verma, S. K., Kiss, T., del Barrio Duque, A., Antonielli, L., Sessitsch, A. & Compant, S. (Vortragende:r, eingeladen), 15 Juli 2024, abstract book MiCROPe 2024.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Microbial Fermentation and Shelf Life of Potential Biotechnological Products Capable of Pesticide Degradation
Kraxberger, K., Kostic, T., Antonielli, L. & Sessitsch, A., 7 Sept. 2024, in: Applied microbiology.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access -
Seed Imbibition and Metabolism Contribute Differentially to Initial Assembly of the Soybean Holobiont
Gerna, D., Antonielli, L., Mitter, B., Clara, D. & Roach, T., 11 Jan. 2024, in: Phytobiomes Journal. 8, 1, S. 21-33 13 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access -
Soil pH, developmental stages and geographical origin differently influence the root metabolomic diversity and root-related microbial diversity of Echium vulgare from native habitats
Csorba, C., Rodić, N., Antonielli, L., Sessitsch, A., Vlachou, A., Ahmad, M., Compant, S., Puschenreiter, M., Molin, E. M., Assimopoulou, A. N. & Brader, G., 2024, in: Frontiers in Plant Science. 15, S. 1369754 19 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Towards microbiome preservation: The first insights from soil microbiome preservation experiment
Pipponzi, S. (Vortragende:r), Bonnin, M., Vieira, S., Antonielli, L., Möller, L., Overmann, J., Kostic, T. & Ryan, M., 2024, abstract book Europe Biobank Week 2024.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Two Paenibacillus spp. strains promote grapevine wood degradation by the fungus Fomitiporia mediterranea: from degradation experiments to genome analyses
Haidar, R., Compant, S., Robert, C., Antonielli, L., Yacoub, A., Grélard, A., Loquet, A., Brader, G., Guyoneaud, R., Attard, E. & Rey, P., 9 Juli 2024, in: Scientific Reports. 14, 1, S. 15779 15 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Unexplored microbial diversity from 2,500 food metagenomes and links with the human microbiome
Carlino, N., Blanco-Míguez, A., Punčochář, M., Mengoni, C., Pinto, F., Tatti, A., Manghi, P., Armanini, F., Avagliano, M., Barcenilla, C., Breselge, S., Cabrera-Rubio, R., Calvete-Torre, I., Coakley, M., Cobo-Díaz, J. F., De Filippis, F., Dey, H., Leech, J. & Klaassens, E. S. &24 mehr, , 16 Aug. 2024, (Elektronische Veröffentlichung vor Drucklegung) in: Cell.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access -
2023
Assembly of Endophytic Communities of Setaria viridis Plants when Grown in Different Soils and Derived from Different Seeds
Rodríguez, C. E., Antonielli, L., Mitter, B. & Sessitsch, A., März 2023, in: Phytobiomes Journal. S. 34-45 12 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access -
Bacterial-fungal interactions and impacts on plant growth and health
Compant, S. (Vortragende:r, eingeladen), Wallner, A., Kiss , T., del Barrio Duque, A., Antonielli, L., Sessitsch, A. & Nybroe, O., 24 Okt. 2023, abstract book fungal interactions and impacts on plant growth and health. 7TH PARTNERSHIPS IN BIOCONTROL, BIOSTIMULANTS & MICROBIOME CONGRESS.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Bacterial-fungal interactions and impacts on plant growth and health
Wallner, A., Kiss , T., del Barrio Duque, A., Antonielli, L., Sessitsch, A., Nybroe, O. & Compant, S. (Vortragende:r, eingeladen), 14 Sept. 2023, abstract book ICGEB Workshop Trends in microbial solutions for sustainable agriculture .Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Chemosensory proteins as putative semiochemical carriers in the desert isopod Hemilepistus reaumurii
Iannucci, A., Zhu, J., Antonielli, L., Ayari, A., Nasri-Ammar, K., Knoll, W., Pelosi, P. & Dani, F. R., Nov. 2023, in: Insect Biochemistry and Molecular Biology. 162, 8 S., 104012.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access -
Correction to: Potato root-associated microbiomes adapt to combined water and nutrient limitation and have a plant genotype-specific role for plant stress mitigation
Faist, H., Trognitz, F., Antonielli, L., Symanczik, S., White, P. J. & Sessitsch, A., 25 Apr. 2023, in: Environmental Microbiome. 18, 1, S. 37 5 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Diverse bacteria colonizing leaves and the rhizosphere of lettuce degrade azoxystrobin
Kraxberger, K., Antonielli, L., Reichenauer, T. & Sessitsch, A., 15 Sept. 2023, in: The Science of the Total Environment. 891, 12 S., 164375.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Plant microbiota from rhizosphere to seeds
Faist, H., Csorba, C., Escobar-Rodríguez, C., Trognitz, F., Brader, G., Antonielli, L., Kostic, T. & Sessitsch, A. (Vortragende:r, eingeladen), 11 Juli 2023, FEMS 2023 abstract book.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Potato root-associated microbiomes adapt to combined water and nutrient limitation and have a plant genotype-specific role for plant stress mitigation
Faist, H., Trognitz, F., Antonielli, L., Symanczik, S., White, P. J. & Sessitsch, A., 14 März 2023, in: Environmental Microbiome. 18, 5 S., 37.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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2022
A multi-omics approach to disentangle factors underlying a crop’s storability
Molin, E. M. (Vortragende:r), Tucek, L., Rohringer, S., Antonielli, L., Mayrhofer, M. & Eigner, H., 2022, abstract book miCROPe 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Deciphering the anthosphere and endosphere microbiome of wild Rosaceae plants for cold-adapted plant growth-promoting bacteria
Marian, M., Milanese, I., Antonielli, L., Pertot, I. & Perazzolli, M., 2022, abstract book miCROPe 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation
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Development of biocontrol applications against fungal and oomycete diseases
Trognitz, F. (Vortragende:r, eingeladen), Antonielli, L. (Autor:in, eingeladen), Ringwald, T. (Autor:in, eingeladen), Ley, J. M. (Autor:in, eingeladen) & Sessitsch, A. (Autor:in, eingeladen), 2022, abstract book miCROPe 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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Ecological and functional analysis of the microbiota associated with a vascular Antarctic plant
Perazzolli, M. (Vortragende:r), Vicelli, B., Antonielli, L., Longa, C. M. O., Bozza, E., Bertini, L., Caruso, C. & Pertot, I., 2022, abstract book miCROPe 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Vortrag mit Beitrag in Tagungsband
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In-depth genome analysis of Bacillus sp. BH32, a salt stress-tolerant endophyte obtained from a halophyte in a semiarid region
Belaouni, H. A., Compant, S., Antonielli, L., Nikolic, B., Zitouni, A. & Sessitsch, A., 2022, in: Applied Microbiology and Biotechnology. 108, S. 3113-3137 25 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Interaction between bacteria and the mycorrhiza-like fungus Serendipita indica to enhance plant resistance against plant pathogens
del Barrio Duque, A., Antonielli, L., Sessitsch, A., Nybroe, O. & Compant, S. (Vortragende:r), 2022, abstract book International Phytobiomes Conference 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation
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Metabolite Production in Alkanna tinctoria Links Plant Development with the Recruitment of Individual Members of Microbiome Thriving at the Root-Soil Interface
Csorba, C., Rodić, N., Zhao, Y., Antonielli, L., Brader, G., Vlachou, A., Tsiokanos, E., Lalaymia, I., Declerck, S., Papageorgiou, V. P., Assimopoulou, A. N. & Sessitsch, A., 2022, in: mSystems. 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Microbiome-based diagnostic tools for improving primary crop production
Kostic, T. (Vortragende:r), Antonielli, L., Ley, J. M., Quijada, N. M., Pastar, M., Padrisa, O. P., Galy, H., Baleum, J. & Sessitsch, A., 2022, abstract book International Phytobiomes Conference 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation
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Plant organ and sampling time point determine the taxonomic structure of microbial communities associated to apple plants in the orchard environment
Oliveira Longa, C. M., Antonielli, L., Bozza, E., Sicher, C., Pertot, I. & Perazzolli, M., 2022, in: Microbiological Research. 258, 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Seed imbibition and germination-associated metabolism differentially shape early soybean bacterial communities
Gerna, D., Clara, D., Antonielli, L., Mitter, B. & Roach, T., 2022, abstract book miCROPe 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation
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Simulated global warming affects endophytic bacterial and fungal communities of Antarctic pearlwort leaves and some bacterial isolates support plant growth at low temperatures
Perazzolli, M., Vicelli, B., Antonielli, L., Longa, C. M. O., Bozza, E., Bertini, L., Caruso, C. & Pertot, I., 2022, in: Scientific Reports. 12, 18839, 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Soil composition and rootstock genotype drive the root associated microbial communities in young grapevines
Darriaut, R., Antonielli, L., Martins, G., Ballestra, P., Vivin, P., Marguerit, E., Mitter, B., Masneuf-Pomarède, I., Compant, S., Ollat, N. & Lauvergeat, V., 2022, in: Frontiers in Microbiology. 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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The seed bacterial microbiome: lessons from the C4-model grass Setaria viridis L.
Escobar-Rodríguez, C., Mitter, B., Antonielli, L., Compant, S. & Sessitsch, A., 2022, abstract book miCROPe 2022. 1 S.Publikation: Beitrag in Buch oder Tagungsband › Beitrag in Tagungsband mit Posterpräsentation
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Variations in fungal community structure along elevation gradients in contrasting Austrian Alpine ecosystems
Bhople, P., Samad, A., iić, A., Antonielli, L., Sessitsch, A., Keiblinger, K., Djukic, I., Zehetner, F., Zechmeister-Boltenstein, S., Joergensen, R. G. & Murugan, R., 2022, in: Applied Soil Ecology. 177, 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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2021
16S rRNA gene based microbiome analysis identifies candidate bacterial strains that increase the storage time of potato tuber
Buchholz, F., Junker, R. R., Samad, A., Antonielli, L., Saric, N., Kostic, T., Sessitsch, A. & Mitter, B., 2021, in: Scientific Reports. 11, 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Bacteria associated with wood tissues of Esca-diseased grapevines: functional diversity and synergy with Fomitiporia mediterranea to degrade wood components
Haidar, R., Yacoub, A., Vallance, J., Compant, S., Antonielli, L., Saad, A., Habenstein, B., Kauffmann, B., Grelard, A., Loquet, A., Attard, E., Guyoneaud, R. & Rey, P., 2021, in: Environmental Microbiology. 10, S. 6104-6121 18 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Do Aerial Nitrogen Depositions Affect Fungal and Bacterial Communities of Oak Leaves?
Borruso, L., Bani, A., Pioli, S., Ventura, M., Panzacchi, P., Antonielli, L., Giammarchi, F., Polo, A., Tonon, G. & Brusetti, L., 2021, in: Frontiers in Microbiology. 12Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Effect of a Wood-Based Carrier of Trichoderma atroviride SC1 on the Microorganisms of the Soil
Chammem, H., Antonielli, L., Nesler, A., Pindo, M. & Pertot, I., 2021, in: Journal of Fungi. 7, 9Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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In planta Activity of Novel Copper(II)-Based Formulations to Inhibit the Esca-Associated Fungus Phaeoacremonium minimum in Grapevine Propagation Material
Battiston, E., Compant, S., Antonielli, L., Mondello, V., Clement, C., Simoni, A., Di Marco, S., Mugnai, L. & Fontaine, F., 2021, in: Frontiers in Plant Science. 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Modulation of plant root growth by nitrogen source‐defined regulation of polar auxin transport
Ötvös, K., Marconi, M., Vega, A., O´Brien, J., Johnson, A., Abualia, R., Antonielli, L., Montesinos, J. C., Zhang, Y., Tan, S., Cuesta, C., Bouguyon, E., Artner, C., Gojon, A. & Gutiérrez, R. A., 2021, in: EMBO Journal. 40Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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2020
Comparative genomic of Dactylonectria torresensis strains from grapevine, soil and weed highlights potential mechanisms in pathogenicity and endophytic lifestyle
Gramaje, D., Berlanas, C., del Pilar Martinez-Diz, M., Diaz-Losada, E., Antonielli, L., Beier, S., Gorfer, M., Schmoll, M. & Compant, S., 2020, in: Journal of Fungi. 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Comparative Genomics of Microbacterium Species to Reveal Diversity, Potential for Secondary Metabolites and Heavy Metal Resistance
Corretto, E., Antonielli, L., Sessitsch, A., Höfer, C., Puschenreiter, M., Widhalm, S., Swarnalakshmi, K. & Brader, G., 2020, in: Frontiers in Microbiology. 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Heritability and Functional Importance of the Setaria viridies Bacterial Seed Microbiome
Escobar-Rodríguez, C., Antonielli, L., Mitter, B., Trognitz, F. & Sessitsch, A., 2020, in: Phytobiomes Journal. 4, S. 40-52 13 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
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Interaction between endophytic Proteobacteria strains and Serendipita indica enhances biocontrol activity against fungal pathogens
del Barrio Duque, A., Samad, A., Nybroe, O., Antonielli, L., Sessitsch, A. & Compant, S., 2020, in: Plant and Soil. 1 S.Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Begutachtung
Open Access