Konzept zur Kombination von Loose und Stringent Clustering Algorithmen zur cDNA Klon Selektion

  • Schreier, G. (Author)
  • Martin Huber (Author)
  • Silvia Fluch (Author)

Activity: Talk or presentation / Lecture › Presentation at a scientific conference / workshop

Description

In der funktionalen Genomanalyse sind cDNA Microarrays nicht mehr wegzudenken. Ein Problem bei der Herstellung solcher EST-Microarrays ist die Redundanz, die diese Sequenzen aufweisen können. Die beschränkten Ressourcen des Microarrays in Bezug zur Anzahl der vorhandenen cDNA Klone, hier im speziellen die Populus sp. cDNA Klone der Platform for Integrated Clone Management, erfordern eine Reduktion der KLone mit redundanter genetischer Information auf ein Minimum. Das dazu entwickelte Konzept erlaubt es, verschiedene bereits etablierte Clusteringverfahren zu verwenden und diese unter Berücksichtigung der KOmpatibilität frei zu kombinieren.
Period10 Nov 2005 → 12 Nov 2005
Event titleÖGBMT Jahrestagung 2005
Event typeConference
Degree of RecognitionInternational

Research Field

  • Not defined

Keywords

  • Bioinformatik
  • gene clustering
  • expressed sequence tags - EST
  • Microarray